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Apr 30, 2024

Diagnostische Leistung von GeneXpert MTB/RIF beim Nachweis von MTB im Abstrich

BMC Infectious Diseases Band 22, Artikelnummer: 321 (2022) Diesen Artikel zitieren Tuberkulose (TB) ist weltweit eine der häufigsten Ursachen für Morbidität und Mortalität. Die Kontrolle der Tuberkulose bleibt aufgrund des Mangels bestehen

BMC Infectious Diseases Band 22, Artikelnummer: 321 (2022) Diesen Artikel zitieren

Tuberkulose (TB) ist weltweit eine der Hauptursachen für Morbidität und Mortalität. Aufgrund des Mangels an einfachen, schnellen und dennoch genauen Diagnosetests wird die Tuberkulose weiterhin unter Kontrolle gebracht. Daher wird die Diagnose bei einer abstrichnegativen Lungentuberkulose häufig nicht gestellt. Die Studie bewertete die Leistung des GeneXpert MTB/RIF-Assays zum Nachweis von Mycobacterium tuberculosis (MTB).

Die Studie wurde von Juni bis Dezember 2016 im Nepal Tuberculosis Center, Bhaktapur, Nepal, durchgeführt. Insgesamt wurden 173 Sputumproben gesammelt und mikroskopisch verarbeitet [Auramin-O-Färbung und Ziehl-Neelsen (ZN)-Färbung], gefolgt von einem GeneXpert MTB/RIF-Assay und einer Kultur in Lowenstein-Jensen (LJ)-Medium.

Von 173 Sputumproben waren 162 (93,6 %) abstrichnegativ. Von 162 abstrichnegativen Sputumproben wurde bei 35 (21,6 %) durch Kultur und bei 31 (19,1 %) durch den GeneXpert MTB/RIF-Assay bestätigt, dass sie MTB aufwiesen. Von den 31 GeneXpert-positiven Proben waren 25 (80,6 %) empfindlich, 4 (12,9 %) waren resistent und 2 (6,45 %) waren mittelmäßig gegenüber Rifampicin. Die Sensitivität, Spezifität, der positive Vorhersagewert und der negative Vorhersagewert des GeneXpert MTB/RIF-Assays für abstrichnegative Sputumproben betrugen 74,3 %, 96,6 %, 86,7 % bzw. 92 %. Der GeneXpert MTB/RIF weist eine erhebliche diagnostische Übereinstimmung von 90,91 % mit der Kultur auf (Cohens Kappa-Koeffizient = 0,73).

Die diagnostische Leistung des GeneXpert MTB/RIF-Assays war nahezu gleichwertig mit der Kultur und kann daher beim MTB-Nachweis in ausstrichnegativen Sputumproben zuverlässig durchgeführt werden.

Peer-Review-Berichte

Tuberkulose (TB), eine durch Mycobacterium tuberculosis (MTB) verursachte Infektion, betrifft normalerweise die Lunge, kann aber auch andere Körperteile befallen. Lungentuberkulose (PTB) verbreitet sich leicht durch Aerosole [1]. Weltweit ist Tuberkulose eine der häufigsten Todesursachen durch eine einzelne Infektion. Im Jahr 2019 gab es schätzungsweise 10 Millionen neue Fälle von Tuberkulose, von denen nur 7 Millionen Fälle gemeldet wurden. Außerdem gab es schätzungsweise 1,4 Millionen MTB-bedingte Todesfälle. Ebenso gab es schätzungsweise 0,5 Millionen neue Fälle von Rifampicin-resistenter Tuberkulose, von denen 78 % multiresistente Tuberkulose (MDR-TB) waren, aber nur 206.030 Fälle von MDR-TB wurden gemeldet [2]. Die geringere Wirksamkeit des Diagnosealgorithmus ist einer der Hauptgründe für geringere Benachrichtigungen [2].

Die Sputumkultur ist der Goldstandard für die Diagnose von Tuberkulose. Allerdings ist es teuer, kontaminationsanfällig, arbeitsintensiv und zeitaufwändig [3, 4]. Dies führt zu einer verzögerten Behandlung und einer erhöhten Übertragung [5]. Daher spielt eine frühzeitige Diagnose eine entscheidende Rolle bei der Behandlung und Kontrolle von Tuberkulose. Die Sputumabstrich-Mikroskopie ist schnell und kostengünstig und wird daher immer noch als Erstlinientechnik für die TB-Diagnose eingesetzt, insbesondere in ressourcenarmen Umgebungen. Es mangelt jedoch an Sensitivität (20–80 %) und Reproduzierbarkeit [6, 7]. Daher ist der Einsatz eines alternativen Schnelldiagnosetools bei der Behandlung von Tuberkulose unverzichtbar.

Der GeneXpert MTB/RIF (Xpert) Assay (Cepheid, Sunnyvale, CA, USA) ist ein automatisierter Nukleinsäureamplifikationstest. Es kann den M. tuberculosis-Komplex und die Rifampin-Resistenz-assoziierte Mutation innerhalb von zwei Stunden erkennen. In Umgebungen mit höherer Prävalenz hat Xpert eine gepoolte Sensitivität von 69,4–84,7 % und eine Spezifität von 98,4–98,8 % [8, 9]; In ähnlicher Weise weist Xpert eine gepoolte Sensitivität von 60,6–67 % und eine gepoolte Spezifität von 98,8 % in schmiernegativen Sputumproben auf [9, 10]. Die Technik wird von der Weltgesundheitsorganisation (WHO) als Point-of-Care-Test für die Diagnose von pulmonaler und extrapulmonaler Tuberkulose empfohlen. Die vollständige Nutzung von Xpert in Umgebungen mit geringen Ressourcen stellt jedoch eine Herausforderung dar, da eine konstante Stromversorgung, enorme Kapitalinvestitionen für Geräte und Verbrauchsmaterialien sowie eine kontinuierliche Wartung erforderlich sind [11]. Dennoch werden Xpert-Tests mit dem Tochterprogramm des globalen Fonds in großem Umfang in ressourcenbeschränkten Umgebungen mit einer höheren TB-Belastung eingesetzt. In Nepal wurde Xpert erstmals im Jahr 2012 implementiert [12].

Die Armutsquote in Nepal ist hoch [4] und Armut ist ein Tuberkulose-Risikofaktor [6]. Fast die Hälfte der Bevölkerung Nepals ist vermutlich an Tuberkulose erkrankt. Im Jahr 2020 wurde die Gesamtinzidenz von Tuberkulose auf 68.000 geschätzt, von denen nur 27.745 gemeldet wurden, und die durch Tuberkulose verursachte Mortalität lag bei 17.220. Dies entspricht 189 neuen Fällen, 101 verpassten Fällen und 47 Todesfällen pro Tag [13]. Die HIV-positive TB-Inzidenz in Nepal betrug 490, während die HIV-positive TB-Mortalität 220 betrug [13]. Seit 2016 wird im ganzen Land die landesweite „End TB Strategy“ umgesetzt. Die Behandlung von Tuberkulose ist in Nepal kostenlos. Im Jahr 2020 wurden etwa 1,8 Milliarden NPR (1 USD = 118,5 NPR) für Tuberkulose ausgegeben [13]. Dennoch hat die WHO Nepal kürzlich in eine Gruppe von 30 Ländern mit hoher MDR/RR-TB-Belastung aufgenommen (MDR/RR-TB-Belastung = 2.200) [13, 14]. Ausgehend von der steigenden Tuberkuloseprävalenz in Nepal und dem Bedarf an geeigneten Diagnosealgorithmen wurde die Studie daher durchgeführt, um den Nutzen von Xpert für die schnelle Diagnose von abstrichnegativer Tuberkulose in einer Umgebung mit hoher Belastung, Kathmandu in Nepal, zu bewerten.

Die krankenhausbasierte Querschnittsstudie wurde von Juni bis Dezember 2016 im National Tuberculosis Centre (NTC) in Bhaktapur (auf der Ostseite des Kathmandu-Tals) in Nepal durchgeführt. NTC ist der Schwerpunkt des nationalen Tuberkulose-Programms in Nepal. NTC formuliert Richtlinien, Strategien, Planung, Überwachung und Qualitätssicherung von TB-Programmen. Das Zentrallabor des NTC ist für die Planung, Schulung, Überwachung, Überwachung, Bewertung und Qualitätskontrolle des Labornetzwerks im Land verantwortlich. NTC bietet außerdem diagnostische Dienste für alle Arten von vermuteter Tuberkulose für die Menschen im Kathmandu-Tal und im Rest des Landes an. Das Kathmandu-Tal ist eine sehr dichte Umgebung mit der Hauptstadt Kathmandu. Die Bevölkerung des Tals beträgt etwa 2,5 Millionen, die tatsächliche Zahl liegt jedoch bei etwa 4 Millionen. Die Bevölkerungsdichte beträgt 2.793. Bei dieser Studie handelte es sich bei der Stichprobe um mutmaßliche Tuberkulosefälle aller Altersgruppen und Geschlechter, die das Zentrum besuchten. Bei den mutmaßlichen Tuberkulosefällen handelte es sich um Patienten mit Symptomen oder Anzeichen, die auf Tuberkulose hindeuteten, z. B. produktiver Husten über zwei oder mehr Wochen, begleitet von einem oder mehreren der folgenden Symptome: Nachtschweiß, Appetitlosigkeit, Fieber, unbeabsichtigter Gewichtsverlust, Brustschmerzen, Kurzatmigkeit , Müdigkeit und Unwohlsein. In die Studie wurden Patienten einbezogen, deren Sputumproben negativ ausfielen. Patienten, die sich bereits wegen PTB in Behandlung befanden oder bei denen bereits vor 1–3 Jahren eine Tuberkulose diagnostiziert worden war, sowie Patienten mit Verdacht auf extrapulmonale Tuberkulose wurden von der Studie ausgeschlossen.

Insgesamt wurden 173 Sputumproben von geeigneten Patienten entnommen. Die Patienten wurden zunächst richtig beraten, eine gute Sputumprobe zu entnehmen. Unter Aufsicht wurden von jedem Patienten zwei Sputumproben entnommen. Bei Kindern und Erwachsenen, die nicht in der Lage waren, Sputum abzuhusten, wurde Sputum mithilfe des Verneblers mit hypertoner Kochsalzlösung induziert. Die erste Probe wurde vor Ort entnommen und die zweite Probe war eine Frühmorgenprobe des nächsten Tages (Morgenprobe). Die Proben wurden in einem sterilen, auslaufsicheren, transparenten Weithals-Kunststoffbehälter (50-ml-Falcon-Röhrchen) gesammelt. Die Qualität der Sputumprobe wurde makroskopisch beurteilt. Die Proben, die hauptsächlich Speichel und Nasensekret enthielten, wurden verworfen und die Probenentnahme wiederholt. Die Proben wurden gut beschriftet und sofort verarbeitet oder bei 2 bis 8 °C gelagert. Die demografischen Daten der Patienten, einschließlich Alter, Geschlecht und Rauchgewohnheiten, wurden ebenfalls erfasst.

Die Sputumproben wurden mikroskopisch auf das Vorhandensein säurefester Bakterien (AFB) mittels Auramin-O-Färbung und Ziehl-Neelsen-Färbung (ZN) untersucht [15]. Wenn beide Proben, d. h. Spot- und Morgenproben desselben Patienten, in beiden Färbungen keine AFBs ergaben, wurde die Probe als abstrichnegativ angesehen. Die ausstrichnegativen Proben wurden weiterverarbeitet.

Alle Verfahren für den Xpert-Assay wurden gemäß den Anweisungen des Herstellers durchgeführt [16]. Kurz gesagt, das Probenreagenz (Mischung aus NaOH und Isopropanol) wurde im Verhältnis 1:2 den Sputumproben im Falcon-Röhrchen zugesetzt. Die Mischung wurde gründlich gevortext, bis die klare Lösung sichtbar war, und 15 Minuten lang bei Raumtemperatur inkubiert, um die biologische Gefahr durch Reduzierung der Lebensfähigkeit von M. tuberculosis zu minimieren. Anschließend wurden mit Hilfe einer sterilen Pipette 2 ml klare Lösung in die etikettierte Kartusche gegeben und die Kartusche im Xpert-Gerät inkubiert. Die Ergebnisse wurden im Xpert-System innerhalb von 2 Stunden erhalten. Die Proben, die in mindestens einer der beiden Kartuschen mit zwei Sputumproben, d. h. Spot- und Morgenproben, in Xpert positive Ergebnisse lieferten, wurden als von Xpert bestätigte Tuberkulose angesehen.

Die Sputumproben wurden nach der modifizierten Petroff-Methode aufgeschlossen und dekontaminiert [17]. Die verdauten Sputumproben wurden zur Kultur auf Lowenstein Jensen (LJ)-Medien geimpft. Alle inokulierten LJ-Medien (Steigungen) wurden 8 Wochen lang bei 37 °C inkubiert. Das raue, polierte und zähe Wachstum des LJ-Mediums wurde außerdem einer ZN-Abstrichmikroskopie und biochemischen Tests unterzogen, um M. tuberculosis zu bestätigen [4]. M. tuberculosis wurde durch ihre langsame Wachstumsrate, Koloniemorphologie, Unfähigkeit, auf LJ-Medien mit p-Nitrobenzoesäure (500 μg/ml) zu wachsen, Niacintest und Katalasetest bestätigt [4]. Die Proben, die mindestens eine der beiden Kulturen von zwei Sputumproben, dh Spot- und Morgenkulturen, mit M. tuberculosis-Wachstum ergaben, wurden als kulturbestätigte Tuberkulose angesehen. Die kulturell bestätigte Tuberkulose galt als definitive Diagnose.

Alle generierten Daten wurden mit Microsoft Excel Version 2016 eingegeben und kuratiert. Die statistischen Analysen wurden mit der R-Software Version 4.1.1 durchgeführt. Zur Beschreibung der demografischen Variablen wurde eine deskriptive Analyse verwendet. Beschreibende Statistiken wurden als Prozentsätze ausgedrückt. Die Kontingenz der kategorialen Variablen wurde mithilfe des Chi-Quadrat-Tests (χ2) beobachtet. Der Phi-Koeffizient von Pearson wurde verwendet, um die Effektgröße zwischen den Variablen zu messen. Der Phi-Koeffizient wurde anhand der Faustregeln von Cohen interpretiert. Ein p-Wert < 0,01 wurde als statistisch signifikant angesehen. Sowohl Kultur- als auch Abstrich-negative Proben wurden als echte TB-negative betrachtet. Unter Verwendung von kulturbestätigter Tuberkulose als Referenzstandard wurde die Wirksamkeit des Xpert anhand der Kultur beurteilt, indem die Schätzung der Messgrößen berechnet wurde, d. h. Sensitivität, Spezifität, positiver Vorhersagewert (PPV) und negativer Vorhersagewert (NPV). Die Schätzungen der Maßnahmen wurden nach folgender Formel berechnet:

\({\text{NPV}} = {\text{d}}/\left( {{\text{c}} + {\text{d}}} \right)\) wobei a = richtig positiv, b = falsch positiv, c = falsch negativ und d = richtig negativ.

Der Standardfehler (SE), die Fehlerspanne (M) und das 95 %-Konfidenzintervall (CI) wurden unter Verwendung der folgenden Formel berechnet:

\({\text{SE}} = {\text{Quadratwurzel }}\left[ {\left\{ {{\text{p}}*\left( {{1} - {\text{ p}} } \right)} \right\}/{\text{N}}} \right]\), wobei p eine Schätzung der Maße und N = die Anzahl der wahren Werte der Stichproben gemäß dem Goldstandard ist.

Alle Schätzungen wurden in Prozent ausgedrückt. In ähnlicher Weise wurde der Kappa-Koeffizient (κ) von Cohen verwendet, um die Interbewerter-Übereinstimmung von Xpert mit Kulturberichten zu messen. Der Kappa-Koeffizient von Cohen wurde anhand der Cohen-Kriterien interpretiert. Die von Cohen verwendeten Kriterien waren die Werte ≤ 0 als Hinweis auf keine Übereinstimmung, 0,01–0,20 als keine bis leichte Übereinstimmung, 0,21–0,40 als ziemliche Übereinstimmung, 0,41–0,60 als mäßige Zustimmung, 0,61–0,80 als wesentliche Übereinstimmung und 0,81–1,00 als fast perfekte bis perfekte Übereinstimmung.

Von 173 mutmaßlichen Tuberkulosepatienten waren 162 (93,6 %) im Abstrich negativ, während 11 (6,4 %) im Abstrich positiv waren. Von diesen 162 Patienten mit Verdacht auf Tuberkulose im Abstrich waren 35 (21,60 %) kulturpositiv für MTB, während Xpert MTB nur in 31 (19,14 %) Fällen nachwies. Außerdem wurde bei 4 (2,47 %) ein Rifampicin-resistentes MTB nachgewiesen (Tabelle 1).

Die diagnostische Leistung von Xpert war der von Kultur nahezu ähnlich. Es gab keinen inhaltlich signifikanten Zusammenhang zwischen dem Xpert-Assay und den demografischen Merkmalen der Patienten (Geschlecht, Alter, Rauchgewohnheiten). Das Gleiche galt auch für die Kultur (Tabelle 2).

Von 162 Abstrich-negativen Proben waren in Xpert 9 falsch negativ und 5 falsch positiv. Anhand der Kultur als Referenz zeigte Xpert eine hohe diagnostische Leistung. Xpert zeigte einen Cohen-Kappa-Koeffizienten (κ) von 0,73 (dh erhebliche Übereinstimmung). Dies impliziert eine 90,91-prozentige Übereinstimmung von Xpert mit der Kultur (Tabelle 3) (Tabelle 4).

Tuberkulose ist eine globale Bedrohung für die öffentliche Gesundheit, insbesondere in der Dritten Welt. Daher ist die Früherkennung von größter Bedeutung für die Reduzierung von Todesfällen und Übertragungen. Die weltweite Tuberkulosebekämpfung wird durch den Mangel an schnellen und genauen Diagnosetests erschwert.

Die Abstrichmikroskopie ist eine schnelle und kostengünstige Methode zum Nachweis von AFB. Für einen positiven Befund in der Abstrichmikroskopie sollten jedoch mindestens 5.000–10.000 Bazillen pro ml Sputum im Sputum vorhanden sein. Je weniger Bazillen vorhanden sind, desto negativ ist das Ergebnis in der Abstrichmikroskopie. Dadurch ist es weniger empfindlich. Zur Erhöhung der Empfindlichkeit sind dreitägige Sputumproben am frühen Morgen erforderlich. Die infektiöse Dosis der Tuberkulose beträgt weniger als 10 Bakterien, sodass solche Fälle bei der Abstrichmikroskopie leicht übersehen werden können. Den Fällen mit negativem Abstrich fehlen in ressourcenarmen Gebieten wie Nepal häufig diagnostische Algorithmen. Die abstrichnegativen, kulturpositiven Tuberkulosepatienten machen etwa 13 % der Tuberkuloseübertragungen aus. Die Abstrichmikroskopie kann MTB nicht vom MTB-Komplex unterscheiden [18, 19]. Die Kultur ist nach wie vor der Goldstandard für die TB-Erkennung. Es verfügt über eine hohe Empfindlichkeit und kann MTB erkennen, wenn 10 lebensfähige Bakterien pro ml Sputum vorhanden sind. Die Kultur erfordert jedoch einen längeren Zeitraum, der bis zu 4 Wochen betragen kann. Außerdem erfordert die Kultur ein Labor der Biosicherheitsstufe 3 [20, 21].

Diese Prämisse macht Xpert zu einer sehr zuverlässigen Alternative. Xpert kann die Diagnose bei abstrichnegativer und einigen kulturnegativer Tuberkulose verbessern. Das mukopurulente Sputum erhöht die Xpert-Ausbeute [22]. Die Leistung von Xpert war bei Abstrich-negativen mutmaßlichen Tuberkulosefällen nahezu vergleichbar mit der Kultur, unabhängig von der demografischen Zusammensetzung der Patienten und den Rauchgewohnheiten. Die Sensitivität, Spezifität, PPV und NPV von Xpert in Bezug auf die Kulturmethode waren höher. Über die hohe diagnostische Leistung von Xpert wurde auch an anderer Stelle berichtet [8, 9, 23]. Kim et al. [24] berichteten ebenfalls über ähnliche Ergebnisse. In ähnlicher Weise haben Gowda et al. [25] berichteten ebenfalls über ähnliche Sensitivität, Spezifität und NPV, mit Ausnahme des PPV. Die Spezifität von Xpert war mit 96,61 % hoch. Dies kann durch das Vorhandensein falsch-positiver Fälle, also Xpert-positiver Kultur-negativer Fälle, beeinflusst werden. Außerdem können molekulare Techniken wie Xpert die DNA von MTB (sowohl lebensfähige als auch nicht lebensfähige) nachweisen, während in Kultur nur lebensfähige Zellen Wachstum zeigen können. Xpert-positiv bedeutet also nicht zwangsläufig, dass lebensfähige Bakterien vorhanden sind. Daher sollte Xpert nicht zur Überwachung des Ansprechens auf die Behandlung, eines Behandlungsversagens oder eines Rückfalls verwendet werden [22, 26, 27]. Darüber hinaus kann es in solchen Fällen zu unnötiger Behandlung und verzögerter angemessener Behandlung kommen [28]. Die negativen Berichte einer oder mehrerer Proben im Xpert, in der Abstrichmikroskopie [29] oder auch in der Kultur [30] schließen eine PTB nicht unbedingt aus. Der hohe Kapitalwert von Xpert bedeutet, dass es eine entscheidende Rolle bei der Entscheidungsfindung zur Reduzierung der Luftisolation von hospitalisierten mutmaßlichen Tuberkulosefällen spielen kann. Darüber hinaus erwies sich Xpert auch als die kostengünstigste Option [31].

Xpert erkennt auch Rifampicin-Resistenzen. Xpert hatte jedoch die variable Sensitivität und Spezifität zum Nachweis einer Rifampicin-Resistenz nachgewiesen. Die Variation könnte auf falsch positive Rifampicin-resistente Stämme aufgrund der genomischen Mutation, des Ausschlusses von Mischinfektionen und des Auftretens sowohl von Rifampicin-Resistenz als auch von anfälligen MTB-Isolaten in denselben Proben zurückzuführen sein [32]. Die Rifampicin-Resistenz war in dieser Studie sehr gering, was die tatsächliche Evaluierung von Xpert zum Nachweis einer Rifampicin-Resistenz einschränkte. Außerdem konnten wir die von Xpert mithilfe von Arzneimittelempfindlichkeitstests festgestellte Rifampicin-Resistenz nicht bestätigen. Dies ist die Einschränkung dieser Studie, da Rifampicin-resistente und -anfällige Fälle von Xpert nicht weiter bestätigt wurden.

Xpert wird in Nepal seit 2012 eingesetzt. Es wurden nur sehr wenige Studien in kleinen Clustern durchgeführt, dennoch mangelt es an umfassenden Studien zur Leistung von Xpert unter pragmatischen Bedingungen in Nepal. Es ist jetzt entscheidend, die Kosten-Nutzen-Analyse in pragmatischen Situationen durchzuführen, wenn ein einzelner Experte ausreicht; da ein zweiter Experte nur bei HIV-Infektionen wichtig zu sein scheint. Aufgrund der steigenden Kosten wurden hohe Raten nicht diagnostischer Ergebnisse und keine Verbesserung des Anteils der Patienten, die eine Behandlung in Regionen mit hoher Belastung beginnen, berichtet [33,34,35]. Allerdings müssen die höheren Betriebs- und Installationskosten des Xpert ganzheitlich gemessen werden, wobei der Nutzen berücksichtigt werden muss, den es durch die Vermeidung der schlechten Empfindlichkeit und Spezifität der Abstrichmikroskopie bietet.

Dennoch kann der schnellere und genauere Assay Xpert Ärzten dabei helfen, bessere und fundiertere Entscheidungen für die Behandlung mutmaßlicher Tuberkulosefälle zu treffen. Die Ergebnisse der Studie deuten stark darauf hin, dass Xpert als Schnelltest eine wertvolle Ergänzung zur Tuberkulose-Ausrüstung darstellt, die mit klinischen Erkenntnissen für die anfänglichen therapeutischen Entscheidungen der PTB kombiniert werden kann. Dies wiederum kann zu Fortschritten bei Kampagnen zur Tuberkulosebekämpfung führen.

Die höhere Häufigkeit von MTB in der abstrichnegativen Sputumprobe bedeutet, dass die Behörden diesen Bereich im Auge behalten sollten, um eine wirksame MTB-Kontrolle zu gewährleisten. Die diagnostische Leistung des Xpert-Assays war nahezu gleichwertig mit der Kultur und kann daher beim MTB-Nachweis in abstrichnegativen Sputumproben zuverlässig eingesetzt werden.

Erstens könnte der Selektionsbias für einige Fehler in den Ergebnissen verantwortlich gewesen sein. Zweitens wurde die Studie sechs Monate lang durchgeführt und die Gesamtzahl der Stichproben betrug nur 173. Dies ist eine vergleichsweise kleine Stichprobengröße. Daher stellt die Verallgemeinerung der Ergebnisse möglicherweise kein reales Szenario dar. Wir glauben, dass es sich bei dem Forschungsumfeld um das zentrale Tuberkuloselabor des Landes handelt, sodass es das Basisszenario des Landes als Ganzes darstellt. Auch wenn dies impliziert würde, würde die größere Stichprobenpopulation einen besseren Einblick in die pragmatische diagnostische Relevanz von Xpert geben. Drittens wurden die in die Studie einbezogenen mutmaßlichen Tuberkulosefälle nicht nach ihrem Schweregrad differenziert. Dies könnte die Xpert-Leistung beeinträchtigt haben. Viertens wurde die Kultur als Referenzdiagnosetest verwendet. Auch wenn Kultur immer noch als Goldstandard gilt, hat auch sie ihre Grenzen. Die Kultur kann auch falsch negativ sein, und wenn Xpert positiv ist, bedeutet das nicht zwangsläufig, dass das Xpert-Ergebnis falsch positiv ist. Fünftens wurden für alle Xpert-positiven Proben keine phänotypischen Arzneimittelempfindlichkeitstests, kein Liniensondentest und kein MTBDRplus-Genotyp durchgeführt.

Der vollständige Datensatz, der während der Studie generiert und analysiert wurde, wird bereits im Text behandelt. Die Rohdaten können auf begründete Anfrage dem entsprechenden Autor zur Verfügung gestellt werden.

Säurefeste Bakterien

Lowenstein Jensen Medien

Multiresistente Tuberkulose

Multiresistente/Rifampicin-resistente Tuberkulose

Mycobacterium tuberculosis

Nationales Tuberkulosezentrum

Lungentuberkulose

Tuberkulose

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Ziehl-Neelsen-Färbung

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Referenzen herunterladen

Wir danken dem National Tuberculosis Centre (NTC), Bhaktapur, Nepal für die freundliche Zusammenarbeit und Unterstützung.

Keiner.

Abteilung für Mikrobiologie, Shi-Gan International College of Science and Technology, Kathmandu, Nepal

Raksha Rimal, Dhiraj Shrestha, Susil Pyakurel, Rashmi Poudel und Ganesh Rai

Schlüssellabor für Tierpathogenbiologie in Fujian-Taiwan, Hochschule für Tierwissenschaften, Universität für Land- und Forstwirtschaft Fujian, Fuzhou, China

Prasha Shrestha und Kul Raj Rai

Nationales Tuberkulosezentrum, Bhaktapur, Nepal

Gokarna Raj Ghimire

Abteilung für Mikrobiologie, Nepal Medical College und Lehrkrankenhaus, Kathmandu, Nepal

Shiba Kumar Rai

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RR, PS und DS konzipierten und gestalteten die Studienmethodik. RR und RP führten Laboruntersuchungen durch. RR, SP und PS sammelten Daten, analysierten Daten, überprüften die Literatur, bereiteten den Entwurf des Manuskripts vor und redigierten ihn. KRR, GRG, GR, SKR und DS betreuten das gesamte Projekt und redigierten das Manuskript. DS führte eine Datenanalyse durch und erstellte die endgültige Version des Manuskripts. Alle Autoren haben das endgültige Manuskript gelesen und genehmigt.

Korrespondenz mit Susil Pyakurel.

Diese Forschung wurde vom Shi-Gan Institutional Review Committee Kathmandu, Nepal, genehmigt. Eine schriftliche Einverständniserklärung ist im nepalesischen Kontext nicht für alle Fächer möglich, da der Analphabetismus vergleichsweise höher ist. Um den Auswahlfehler zu verringern, wurde daher eine schriftliche Einverständniserklärung von den gebildeten Teilnehmern eingeholt, während eine mündliche Einverständniserklärung von Analphabeten in Anwesenheit von Laborpersonal eingeholt wurde. Im Falle von Kindern wurde in ihrem Namen die Zustimmung der Eltern/Erziehungsberechtigten eingeholt, die von der Ethikkommission genehmigt wurde.

Unzutreffend.

Die Autoren erklären, dass sie keine konkurrierenden Interessen haben.

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Nachdrucke und Genehmigungen

Rimal, R., Shrestha, D., Pyakurel, S. et al. Diagnostische Leistung von GeneXpert MTB/RIF beim Nachweis von MTB bei abstrichnegativen Patienten mit vermuteter Tuberkulose. BMC Infect Dis 22, 321 (2022). https://doi.org/10.1186/s12879-022-07287-5

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Eingegangen: 21. Oktober 2021

Angenommen: 20. März 2022

Veröffentlicht: 01. April 2022

DOI: https://doi.org/10.1186/s12879-022-07287-5

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